สมาคมอุยกูร์แห่งญี่ปุ่น (หรือที่รู้จักในชื่อ Nippon Uyghur Association หรือ Nihon Uiguru Kyokai) เป็นองค์กรพลัดถิ่นที่มีฐานอยู่ในกรุงโตเกียว ประเทศญี่ปุ่น ซึ่งทำหน้าที่สนับสนุนสิทธิของชาวอุยกูร์และส่งเสริมความตระหนักรู้เกี่ยวกับสถานการณ์ด้านสิทธิมนุษยชนในเขตปกครองตนเองซินเจียงอุยกูร์ของประเทศจีน
สมาคมแห่งนี้ทำหน้าที่เป็นตัวแทนหลักของชุมชนชาวอุยกูร์ในญี่ปุ่น และดำเนินงานในฐานะองค์กรสมาชิกของสภาคองเกรสอุยกูร์โลก (World Uyghur Congress - WUC) ด้วยการเป็นพันธมิตรกับ WUC สมาคมอุยกูร์แห่งญี่ปุ่นจึงได้มีส่วนร่วมในความพยายามด้านการรณรงค์ระดับนานาชาติและประสานงานกับองค์กรพลัดถิ่นอื่นๆ ทั่วโลก
กิจกรรมขององค์กรประกอบด้วยการจัดแคมเปญสร้างความตระหนักรู้ต่อสาธารณะ การเข้าร่วมการประชุมทางวิชาการ การยื่นรายงานต่อหน่วยงานด้านสิทธิมนุษยชนระหว่างประเทศ และการมีส่วนร่วมกับเจ้าหน้าที่รัฐบาลและสมาชิกรัฐสภาของญี่ปุ่น โดยมุ่งเน้นการให้ความรู้แก่สาธารณชนชาวญี่ปุ่นเกี่ยวกับวัฒนธรรม ประวัติศาสตร์ และสถานการณ์ทางการเมืองในปัจจุบันที่ส่งผลกระทบต่อชาวอุยกูร์ในประเทศจีน
ประเทศญี่ปุ่นเป็นที่ตั้งของชุมชนชาวอุยกูร์พลัดถิ่นที่มีขนาดเล็กแต่มีความกระตือรือร้น โดยสมาคมแห่งนี้ทำหน้าที่เป็นศูนย์กลางทางวัฒนธรรมและสังคมสำหรับสมาชิกในชุมชน องค์กรได้อำนวยความสะดวกในการจัดกิจกรรมทางวัฒนธรรม โครงการอนุรักษ์ภาษา และการรวมกลุ่มของชุมชน ซึ่งช่วยรักษาอัตลักษณ์ทางวัฒนธรรมของชาวอุยกูร์ในหมู่สมาชิกที่อาศัยอยู่ในญี่ปุ่น
สมาคมมีความกระตือรือร้นเป็นพิเศษในการทำงานร่วมกับสื่อมวลชนและองค์กรภาคประชาสังคมของญี่ปุ่น เพื่อสร้างความตระหนักรู้เกี่ยวกับรายงานการกักขังจำนวนมาก การสอดแนม และการกดขี่ทางวัฒนธรรมในภูมิภาคซินเจียง นอกจากนี้ยังได้มีส่วนร่วมในแถลงการณ์ร่วมกับองค์กรสิทธิมนุษยชนอื่นๆ และได้ให้การเป็นพยานต่อหน้าคณะกรรมาธิการรัฐสภาญี่ปุ่นที่ตรวจสอบสถานการณ์ดังกล่าว
ด้วยการทำงานด้านการสนับสนุน สมาคมอุยกูร์แห่งญี่ปุ่นได้มีส่วนช่วยในการสร้างความตระหนักรู้ที่เพิ่มขึ้นในญี่ปุ่นเกี่ยวกับประเด็นชาวอุยกูร์ ซึ่งช่วยให้ข้อมูลแก่การอภิปรายเชิงนโยบายและส่งเสริมให้ญี่ปุ่นมีส่วนร่วมมากขึ้นกับกลไกด้านสิทธิมนุษยชนระหว่างประเทศที่จัดการกับสถานการณ์ในซินเจียง