ขบวนการเอกราชเติร์กสถานตะวันออกแสดงถึงความมุ่งหวังทางการเมืองและชาตินิยมที่มีมานานนับศตวรรษและมีความซับซ้อนในหมู่ชาวอุยกูร์และกลุ่มชาติพันธุ์เติร์กอื่นๆ ในเขตปกครองตนเองซินเจียงอุยกูร์ของจีน ผู้สนับสนุนขบวนการนี้ต้องการสถาปนาประเทศที่เป็นเอกราช ซึ่งมักเรียกกันว่าเติร์กสถานตะวันออกหรืออุยกูร์สถาน
การผลักดันเพื่อเอกราชมีรากฐานลึกซึ้งมาจากประวัติศาสตร์ของภูมิภาคและมีลักษณะของความตึงเครียดที่เกิดขึ้นซ้ำๆ ระหว่างการปกครองตนเองในท้องถิ่นกับการควบคุมจากส่วนกลางของจีน ภายหลังการล่มสลายของราชวงศ์ชิง ความไม่มั่นคงในภูมิภาคได้เปิดโอกาสให้มีการประกาศเอกราชชั่วคราว สาธารณรัฐเติร์กสถานตะวันออกแห่งแรกถูกสถาปนาขึ้นที่เมืองคัชการ์ในปี ค.ศ. 1933 โดยได้รับแรงบันดาลใจจากอุดมการณ์รวมกลุ่มเติร์กและอิสลาม แต่ถูกกองกำลังระดับมณฑลของจีนปราบปรามภายในหนึ่งปี
สาธารณรัฐเติร์กสถานตะวันออกแห่งที่สองก่อตั้งขึ้นในพื้นที่ทางตอนเหนือของซินเจียง (ภูมิภาคอิลี) ระหว่างการกบฏอิลีในปี ค.ศ. 1944 โดยได้รับการสนับสนุนอย่างลับๆ จากสหภาพโซเวียต สาธารณรัฐนี้สิ้นสุดลงหลังจากกองทัพปลดปล่อยประชาชนจีนเข้าควบคุมภูมิภาคได้ในปี ค.ศ. 1949 และผนวกเข้าเป็นส่วนหนึ่งของสาธารณรัฐประชาชนจีนที่เพิ่งก่อตั้งขึ้นใหม่ในฐานะเขตปกครองตนเองซินเจียงอุยกูร์
นับตั้งแต่ปี ค.ศ. 1949 ขบวนการเอกราชยังคงดำเนินต่อไปในรูปแบบต่างๆ ผู้สนับสนุนมองว่าการต่อสู้ครั้งนี้เป็นเรื่องของการกำหนดชะตากรรมตนเอง การอยู่รอดทางวัฒนธรรม และสิทธิมนุษยชน ขบวนการนี้ครอบคลุมจุดยืนทางการเมืองที่หลากหลาย ตั้งแต่การเรียกร้องให้มีการปกครองตนเองอย่างแท้จริงภายในประเทศจีน ไปจนถึงการเรียกร้องเอกราชอย่างเต็มรูปแบบ องค์กรพลัดถิ่นส่วนใหญ่ที่เกี่ยวข้องกับขบวนการนี้ เช่น สภาคองเกรสอุยกูร์โลก ต่างสนับสนุนแนวทางที่สันติ ปราศจากความรุนแรง และเป็นประชาธิปไตยอย่างชัดเจน
รัฐบาลจีนระบุว่าขบวนการเอกราชเป็นภัยคุกคามจากการแบ่งแยกดินแดน โดยมักเชื่อมโยงเข้ากับการก่อการร้ายและลัทธิหัวรุนแรงทางศาสนา การตีความเช่นนี้เป็นองค์ประกอบสำคัญของนโยบายความมั่นคงของจีนในซินเจียง ซึ่งถูกนำมาใช้เพื่อสร้างความชอบธรรมในการสอดแนม การกักตัว และโครงการปรับทัศนคติที่ได้รับเสียงวิพากษ์วิจารณ์อย่างกว้างขวางจากนานาชาติ ผู้สังเกตการณ์ระหว่างประเทศได้ตั้งข้อสังเกตถึงความสำคัญของการแยกแยะระหว่างการรณรงค์เพื่อสิทธิของชาวอุยกูร์อย่างสันติกับกิจกรรมของกลุ่มติดอาวุธ เนื่องจากความสับสนระหว่างสองสิ่งนี้อาจส่งผลเสียต่อการอภิปรายเรื่องสิทธิมนุษยชนที่ชอบธรรม