日本維吾爾協會（又稱 Nippon Uyghur Association 或 Nihon Uiguru Kyokai）是一個位於日本東京的僑民組織，旨在倡導維吾爾人的權利，並提高公眾對中國新疆維吾爾自治區人權狀況的關注。
該協會是日本維吾爾族群的主要代表機構，也是世界維吾爾代表大會（WUC）的成員組織。透過與世維會的聯繫，日本維吾爾協會參與國際倡議工作，並與全球各地的其他僑民組織進行協調。
該組織的活動包括舉辦公眾意識宣傳活動、參加學術會議、向國際人權機構提交報告，以及與日本政府官員和國會議員進行交流。它致力於向日本公眾普及維吾爾文化、歷史以及目前影響中國維吾爾人的政治局勢。
日本擁有一個規模雖小但活躍的維吾爾僑民社區，該協會亦作為社區成員的文化與社交中心。組織透過舉辦文化活動、語言保存計劃和社區聚會，協助在日生活的僑民維繫維吾爾文化認同。
該協會一直積極與日本媒體及公民社會組織合作，提高公眾對新疆地區大規模拘留、監控及文化壓迫等報導的關注。它曾與其他國際人權組織發表聯合聲明，並在審議相關局勢的日本國會委員會中提供證詞。
透過這些倡議工作，日本維吾爾協會成功提升了日本公眾對維吾爾問題的認識，有助於推動政策討論，並鼓勵日本更積極地參與處理新疆局勢的國際人權機制。